En fait, l'Église en tant qu'institution n'a fait aucun commentaire, dans un sens ou dans l'autre, sur le Da Vinci Code. Le livre n'a pas été placé par le Vatican sur une liste de « livres interdits » et n'a fait l'objet d'aucune sanction officielle. Les personnes concernées sont les catholiques fidèles, clercs et laïcs, qui ont vu le livre semer la confusion parmi les catholiques et les autres chrétiens quant au caractère des personnes de l'Église primitive, à la relation entre Jésus-Christ et Marie-Madeleine et à la doctrine chrétienne orthodoxe.

Bien que beaucoup aient affirmé que les chrétiens ne devraient pas s'inquiéter de ce roman parce qu'il s'agit d'une fiction, Brown lui-même a présenté le livre comme le fruit d'une recherche factuelle. Il ouvre le roman par une « page de faits » qui prétend être une vérité sans fard. En d'autres termes, il veut que les gens croient que les conclusions du roman sont vraies.

Même si Brown n'avait pas annoncé que son livre révélait des « vérités » cachées sur le christianisme, le mécanisme de la fiction n'accorde pas aux auteurs le droit de diffuser des contre-vérités historiques. De même, un roman qui prétendrait révéler que l'Holocauste n'a jamais eu lieu et qu'Adolf Hitler était vraiment un type formidable serait (à juste titre) rejeté par les personnes de bonne volonté du monde entier comme de l'agit-prop antisémite. En effet, à notre époque, un tel livre ne serait probablement jamais publié, du moins par les principaux éditeurs. Si un tel livre ne peut être défendu par l'avertissement « Ce n'est qu'un roman ! », alors d'autres livres qui répandent des contre-vérités historiques ne peuvent pas non plus être défendus comme étant « seulement de la fiction ».